More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2289 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  490  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80 
 
 
240 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80 
 
 
240 aa  400  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  80 
 
 
240 aa  401  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80.42 
 
 
240 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80 
 
 
240 aa  401  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  80 
 
 
240 aa  401  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  80 
 
 
240 aa  401  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.58 
 
 
240 aa  400  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  79.58 
 
 
240 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  79.17 
 
 
240 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  76.67 
 
 
240 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
242 aa  337  9e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.08 
 
 
241 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  66.67 
 
 
241 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  67.08 
 
 
241 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  67.08 
 
 
241 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  66.67 
 
 
241 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  65.42 
 
 
240 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  66.67 
 
 
241 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  65 
 
 
242 aa  334  7e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  66.25 
 
 
241 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  65.42 
 
 
240 aa  334  7.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.25 
 
 
240 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  66.67 
 
 
240 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  66.25 
 
 
241 aa  332  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  65.83 
 
 
241 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  66.25 
 
 
240 aa  329  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.42 
 
 
244 aa  329  3e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  65 
 
 
241 aa  328  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.58 
 
 
244 aa  324  8.000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  64.17 
 
 
241 aa  323  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  66.11 
 
 
247 aa  323  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  65.69 
 
 
257 aa  322  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  65.42 
 
 
242 aa  322  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  65 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  65.42 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  62.76 
 
 
246 aa  317  9e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  61.25 
 
 
243 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  63.33 
 
 
241 aa  317  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  61.67 
 
 
243 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  61.67 
 
 
247 aa  316  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  61.25 
 
 
243 aa  316  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  63.33 
 
 
244 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  63.75 
 
 
240 aa  315  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  64.02 
 
 
257 aa  315  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.5 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  63.33 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.92 
 
 
246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  62.08 
 
 
242 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 
240 aa  310  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  61.25 
 
 
241 aa  310  9e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 
240 aa  310  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0345  ABC transporter-related protein  64.58 
 
 
240 aa  310  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 
242 aa  310  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  63.33 
 
 
240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.92 
 
 
249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  65 
 
 
239 aa  308  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  61.51 
 
 
247 aa  307  8e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  61.86 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  59.58 
 
 
242 aa  305  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
244 aa  305  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  63.11 
 
 
244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  61.25 
 
 
240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.17 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  63.93 
 
 
244 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  60.83 
 
 
260 aa  304  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  60.67 
 
 
249 aa  305  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  58.75 
 
 
249 aa  304  7e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.91 
 
 
244 aa  304  7e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59 
 
 
246 aa  304  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  58.75 
 
 
242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  60 
 
 
240 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  59.58 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  63.11 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  58.75 
 
 
246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  57.92 
 
 
242 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  59.58 
 
 
246 aa  301  5.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  59.41 
 
 
257 aa  301  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  60.83 
 
 
243 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  57.92 
 
 
242 aa  301  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.09 
 
 
244 aa  300  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  61 
 
 
241 aa  299  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  60.08 
 
 
243 aa  299  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 
243 aa  299  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  60 
 
 
266 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  59.17 
 
 
258 aa  298  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  59.58 
 
 
240 aa  298  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  59.5 
 
 
244 aa  297  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 
242 aa  297  8e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  59.17 
 
 
258 aa  297  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>