More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1877 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  100 
 
 
331 aa  684    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  90.27 
 
 
333 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  62.31 
 
 
332 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  60.94 
 
 
332 aa  408  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  61.25 
 
 
332 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  61.25 
 
 
332 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  61.25 
 
 
332 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  60.94 
 
 
332 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  61.25 
 
 
332 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  61.25 
 
 
332 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  60.62 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  61.25 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  62.62 
 
 
332 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  60.31 
 
 
332 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  55.62 
 
 
376 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  58.93 
 
 
321 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  57.19 
 
 
335 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  57.19 
 
 
335 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  49.53 
 
 
344 aa  347  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  48.33 
 
 
374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  47.52 
 
 
412 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  43.12 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  46.48 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  45.79 
 
 
354 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  46.27 
 
 
366 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  42.22 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  45.74 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  41.25 
 
 
321 aa  275  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  44.51 
 
 
359 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  39.43 
 
 
330 aa  253  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  42.17 
 
 
329 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  39.3 
 
 
331 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  41.56 
 
 
328 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  42.46 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  39.81 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  38.05 
 
 
320 aa  242  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  39.38 
 
 
328 aa  242  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  40.49 
 
 
334 aa  242  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  41.16 
 
 
368 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  40.85 
 
 
368 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  40.06 
 
 
333 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  40.06 
 
 
329 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  40.79 
 
 
388 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  40.59 
 
 
361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  38.32 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  38.29 
 
 
328 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  38.17 
 
 
327 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  39.94 
 
 
320 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  37.07 
 
 
333 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  37.27 
 
 
321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  37.82 
 
 
364 aa  222  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  36.25 
 
 
324 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  38.83 
 
 
368 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  38.89 
 
 
361 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  37.5 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  38.89 
 
 
361 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  37.78 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  36.79 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  38.24 
 
 
361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  37.22 
 
 
335 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  35.76 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  36.89 
 
 
368 aa  212  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  35.13 
 
 
326 aa  211  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  37.38 
 
 
336 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  37.38 
 
 
325 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  36.92 
 
 
331 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  35.14 
 
 
358 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  37.74 
 
 
350 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  35.71 
 
 
345 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  37.42 
 
 
353 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  34.19 
 
 
331 aa  205  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  40.41 
 
 
333 aa  205  8e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  34.52 
 
 
331 aa  205  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  37.38 
 
 
324 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  37.13 
 
 
316 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  35.89 
 
 
338 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  35.74 
 
 
334 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  36.68 
 
 
345 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  34.7 
 
 
331 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  40.52 
 
 
299 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  37.22 
 
 
345 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  37.1 
 
 
342 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  37.42 
 
 
340 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  35.96 
 
 
351 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  35.62 
 
 
347 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  38.36 
 
 
345 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  37.42 
 
 
341 aa  202  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  35.29 
 
 
349 aa  202  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  36.1 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  36.1 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  35.81 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  34.36 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1129  biotin synthase  38.61 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  34.91 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  35.62 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  37.74 
 
 
336 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0574  biotin synthase  37.07 
 
 
328 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  35.11 
 
 
374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  36.14 
 
 
331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  35.81 
 
 
361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>