More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1135 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  100 
 
 
145 aa  289  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  79.14 
 
 
163 aa  220  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  49.28 
 
 
159 aa  140  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  44.53 
 
 
162 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  48.46 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  47.18 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  44.93 
 
 
154 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  43.17 
 
 
163 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  37.23 
 
 
183 aa  121  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  46.62 
 
 
164 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  45.86 
 
 
164 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  41.78 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  40.88 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  45 
 
 
158 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  44.17 
 
 
158 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  44.44 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  44.17 
 
 
158 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  43.07 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  42.34 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  39.44 
 
 
173 aa  114  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  41.48 
 
 
168 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  39.16 
 
 
170 aa  113  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  40.97 
 
 
185 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  41.67 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  41.01 
 
 
167 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  42.96 
 
 
165 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  42.96 
 
 
165 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  38.85 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  37.5 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  38.85 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  38.85 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  38.85 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  38.85 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  38.85 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.39 
 
 
163 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  39.55 
 
 
171 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  44.44 
 
 
141 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  38.64 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  38.64 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  38.13 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  38.13 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  38.13 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  37.23 
 
 
187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  38.13 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  41.04 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  42.03 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  38.13 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  37.76 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  38.13 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  38.13 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  38.13 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35.42 
 
 
164 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  39.72 
 
 
163 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  39.57 
 
 
176 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  37.68 
 
 
161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  39.42 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.97 
 
 
174 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  37.31 
 
 
165 aa  107  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  38.06 
 
 
166 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.97 
 
 
174 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  37.31 
 
 
165 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  40.74 
 
 
165 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  41.48 
 
 
164 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  37.31 
 
 
165 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  39.13 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  37.31 
 
 
165 aa  105  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  37.31 
 
 
165 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  37.31 
 
 
165 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  40.58 
 
 
159 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  38.81 
 
 
148 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40.15 
 
 
165 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  37.31 
 
 
165 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40.15 
 
 
165 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  37.41 
 
 
167 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  36.23 
 
 
150 aa  104  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  36.23 
 
 
150 aa  104  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  37.23 
 
 
160 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  37.32 
 
 
533 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  32.86 
 
 
169 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2935  CheW protein  42.19 
 
 
161 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  40.6 
 
 
165 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  37.24 
 
 
184 aa  103  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.03 
 
 
175 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  34.93 
 
 
178 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  36.03 
 
 
174 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  36.03 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  36.03 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  36.03 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.52 
 
 
164 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  36.03 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  36.03 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  35.29 
 
 
171 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  36.03 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  35.29 
 
 
177 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  35.29 
 
 
171 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  35.29 
 
 
177 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  36.03 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  35.29 
 
 
171 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  35.66 
 
 
170 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  35.66 
 
 
170 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>