More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0495 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  61.64 
 
 		 235 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  61.64 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  61.64 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  61.64 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  61.64 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  61.64 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  61.64 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  61.64 
 
 		 235 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  61.64 
 
 		 252 aa  299  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  60.34 
 
 		 235 aa  298  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  61.64 
 
 		 235 aa  296  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  59.74 
 
 		 234 aa  284  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  59.83 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  59.31 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 231 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 231 aa  279  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 231 aa  279  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 231 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 231 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 231 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  58.44 
 
 		 231 aa  278  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  58.44 
 
 		 231 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  58.44 
 
 		 231 aa  277  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  58.44 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.45 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  55.46 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  55.02 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  55.02 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  55.02 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  55.02 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  55.02 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  55.02 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 		 235 aa  255  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  53.88 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  54.15 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0172  response regulator  43.53 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  49.55 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  45.18 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  40.99 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  40.91 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  39.73 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1910  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1787  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03380  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  36.61 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.61 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.16 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.08 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  34.65 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0111  two component transcriptional regulator  34.33 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  34.76 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2590  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  34.76 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  34.76 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2707  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.61 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  33.91 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.68 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  34.76 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  34.76 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.61 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.87 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  34.21 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.98 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  33.78 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  34.96 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.71 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.71 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.71 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>