40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3182 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  50.85 
 
 		 237 aa  120  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  50.4 
 
 		 1461 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  52.42 
 
 		 485 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  50.4 
 
 		 214 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  45.9 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  45.08 
 
 		 180 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  47.97 
 
 		 839 aa  94  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  36.51 
 
 		 1227 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  38.71 
 
 		 373 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  40.31 
 
 		 361 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  37.5 
 
 		 387 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  36 
 
 		 363 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  40 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  38.89 
 
 		 324 aa  60.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  34.19 
 
 		 556 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1586 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  32.43 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  31.48 
 
 		 464 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  29.59 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  32.28 
 
 		 328 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  34.13 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  34.13 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  30.17 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  31.53 
 
 		 119 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  36.71 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  29.31 
 
 		 408 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  31.31 
 
 		 430 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>