More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7254 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7254  ABC transporter related  100 
 
 		 310 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497205  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  72.54 
 
 		 256 aa  331  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  46.88 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  47.01 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 247 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  47.44 
 
 		 259 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  43.29 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  43.67 
 
 		 256 aa  202  8e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  45.83 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  47.19 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  44.17 
 
 		 263 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  44.54 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 263 aa  195  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  45 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  45.83 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  44.59 
 
 		 246 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  46.98 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  47.9 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  45.57 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  44.02 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  41.81 
 
 		 252 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  42.86 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  41.42 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  43.29 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  47.3 
 
 		 258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  47.52 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 248 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  43.53 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  37.86 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  37.99 
 
 		 236 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 249 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 249 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  38.34 
 
 		 265 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 249 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  37.82 
 
 		 273 aa  175  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  46.82 
 
 		 262 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  39.26 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  34.43 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  42.24 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  44.02 
 
 		 255 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  44.44 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  40.76 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  45.67 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  41.32 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  40.57 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  40.17 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  42.61 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  41.3 
 
 		 248 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  44.71 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  40.42 
 
 		 251 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  45.02 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  44.72 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  38.49 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  44.72 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  45.67 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  43.53 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  44.71 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  38.89 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  38.68 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  41.99 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  46.08 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  40.55 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  45.49 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  40.55 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  40.55 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  44.05 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  43.27 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  43.06 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  41.47 
 
 		 275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.31 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  38.37 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.31 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.31 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.78 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.31 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2381  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722045  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  45.63 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  41.31 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  42.31 
 
 		 274 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  37.66 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  36.21 
 
 		 254 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  40.85 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  43.93 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  45.1 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.859541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>