187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6822 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  100 
 
 
503 aa  1011    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  55.37 
 
 
555 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  35.66 
 
 
534 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  29.97 
 
 
547 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  29.59 
 
 
667 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  28.62 
 
 
679 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  30.85 
 
 
677 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  28.66 
 
 
667 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.62 
 
 
595 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  29.76 
 
 
677 aa  104  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  29.39 
 
 
670 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  29.65 
 
 
668 aa  103  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  28.44 
 
 
670 aa  103  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  31.42 
 
 
690 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  29.75 
 
 
673 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  28.36 
 
 
667 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  28.52 
 
 
711 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  27.19 
 
 
670 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  28.78 
 
 
668 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  28.74 
 
 
668 aa  100  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  27.88 
 
 
650 aa  99.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  29.11 
 
 
667 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  29.64 
 
 
677 aa  98.6  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  28.97 
 
 
705 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  31.21 
 
 
690 aa  97.8  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  29.18 
 
 
678 aa  97.8  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  28.78 
 
 
668 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  28.18 
 
 
667 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  27.32 
 
 
714 aa  96.7  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  28.34 
 
 
670 aa  96.7  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  33.2 
 
 
599 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  29.31 
 
 
673 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  28.19 
 
 
680 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  33.97 
 
 
499 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  29.41 
 
 
644 aa  95.1  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  29.74 
 
 
553 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  33.05 
 
 
561 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.62 
 
 
585 aa  93.2  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30 
 
 
594 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  28.57 
 
 
663 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  26.19 
 
 
665 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  27.7 
 
 
571 aa  90.5  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  29.73 
 
 
677 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11190  putative hydrolase, CocE/NonD family  30.64 
 
 
581 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290865  normal  0.803564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  26.67 
 
 
674 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  27.71 
 
 
674 aa  87  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  27.71 
 
 
615 aa  87  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  30.48 
 
 
704 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.8 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  32.41 
 
 
576 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  26.57 
 
 
540 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  27.58 
 
 
558 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  34.94 
 
 
612 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  37.84 
 
 
587 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  28.17 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.97 
 
 
560 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.97 
 
 
560 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  27.09 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  27.09 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  28.07 
 
 
557 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  23.67 
 
 
745 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.13 
 
 
605 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  32.48 
 
 
763 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.92 
 
 
580 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  26.17 
 
 
637 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  27.27 
 
 
549 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.47 
 
 
609 aa  70.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  28.53 
 
 
571 aa  70.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  24.14 
 
 
700 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  35.65 
 
 
645 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.25 
 
 
570 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  27.92 
 
 
560 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  29.94 
 
 
626 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.94 
 
 
626 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  39.13 
 
 
679 aa  69.3  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.08 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.69 
 
 
611 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  27.11 
 
 
628 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29 
 
 
524 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  26.44 
 
 
569 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.96 
 
 
546 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.91 
 
 
678 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.1 
 
 
611 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0281  hypothetical protein  38.14 
 
 
198 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  44.3 
 
 
577 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1297  acylase and diesterase protein  26.36 
 
 
608 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.36424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.75 
 
 
625 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  31.36 
 
 
595 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  25.1 
 
 
582 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  26.23 
 
 
627 aa  64.7  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  28.03 
 
 
641 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.67 
 
 
542 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.27 
 
 
647 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  27.27 
 
 
660 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  31.01 
 
 
537 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.67 
 
 
629 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  26.02 
 
 
598 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.76 
 
 
645 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.18 
 
 
550 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.18 
 
 
663 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>