123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5680 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  81.92 
 
 		 516 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  100 
 
 		 520 aa  1020    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  48.94 
 
 		 383 aa  292  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  48.56 
 
 		 331 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  47.26 
 
 		 381 aa  276  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  43.48 
 
 		 344 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  45.71 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  45.07 
 
 		 375 aa  256  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  40.56 
 
 		 346 aa  253  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  46.13 
 
 		 320 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  45.65 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  44.74 
 
 		 336 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  44.74 
 
 		 336 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  44.74 
 
 		 336 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  43.41 
 
 		 332 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  42.06 
 
 		 332 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  41.28 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  41.28 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  41.28 
 
 		 337 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  38.35 
 
 		 355 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  41.56 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  40.06 
 
 		 337 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3274  allantoicase  41.76 
 
 		 336 aa  230  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  39.82 
 
 		 337 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  40.41 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  40.41 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  39.82 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  39.82 
 
 		 337 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  39.82 
 
 		 337 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  39.82 
 
 		 337 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  39.82 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  39.82 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  39.82 
 
 		 337 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  40.41 
 
 		 337 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  40.83 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  40.41 
 
 		 337 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  39.23 
 
 		 337 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  40.65 
 
 		 336 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  40.95 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  40.41 
 
 		 336 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  40.65 
 
 		 336 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  39.23 
 
 		 337 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  41.12 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  37.54 
 
 		 331 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  40.24 
 
 		 335 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  40.53 
 
 		 335 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  39.76 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  40.24 
 
 		 335 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  37.65 
 
 		 331 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  38.46 
 
 		 334 aa  223  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  40.53 
 
 		 335 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  40.53 
 
 		 335 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  39.39 
 
 		 360 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  37.35 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  39.82 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  40.06 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  40.06 
 
 		 336 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  39.76 
 
 		 357 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  39.76 
 
 		 336 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  39.76 
 
 		 336 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  39.76 
 
 		 336 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  39.76 
 
 		 336 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  39.76 
 
 		 357 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  37.61 
 
 		 343 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  38.14 
 
 		 349 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  31.72 
 
 		 339 aa  183  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  36.31 
 
 		 364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  33.82 
 
 		 333 aa  174  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  52.22 
 
 		 222 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  28.89 
 
 		 814 aa  149  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  38.55 
 
 		 188 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  43.98 
 
 		 197 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  35.8 
 
 		 168 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  42.01 
 
 		 196 aa  106  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  40.94 
 
 		 163 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 169 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  41.61 
 
 		 193 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  38.89 
 
 		 231 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  38.51 
 
 		 165 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  34.86 
 
 		 165 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  37.29 
 
 		 164 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  37.66 
 
 		 165 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  36.84 
 
 		 177 aa  90.5  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  42.11 
 
 		 179 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  36.09 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  35.32 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  32.14 
 
 		 825 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  36.09 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  41.73 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  34.56 
 
 		 139 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  36.03 
 
 		 138 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  36.21 
 
 		 166 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  34.09 
 
 		 166 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  36.09 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  26.29 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  39.25 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  38.16 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  38.16 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  27.52 
 
 		 166 aa  59.3  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  38.68 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>