70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0542 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  96.72 
 
 		 335 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  100 
 
 		 335 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  96.72 
 
 		 335 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  92.54 
 
 		 335 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  97.01 
 
 		 335 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  95.22 
 
 		 335 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  99.1 
 
 		 335 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  87.5 
 
 		 336 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  86.61 
 
 		 336 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  88.1 
 
 		 336 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  87.8 
 
 		 357 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  87.8 
 
 		 336 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  87.8 
 
 		 336 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  87.8 
 
 		 357 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  87.8 
 
 		 336 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  87.8 
 
 		 336 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  86.61 
 
 		 336 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  83.88 
 
 		 336 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  77.18 
 
 		 337 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  77.18 
 
 		 337 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  78.98 
 
 		 337 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  78.98 
 
 		 337 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  77.48 
 
 		 337 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  78.98 
 
 		 337 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  77.18 
 
 		 337 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  78.98 
 
 		 384 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  78.98 
 
 		 384 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  77.48 
 
 		 337 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  77.18 
 
 		 337 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  78.98 
 
 		 337 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  77.18 
 
 		 337 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  77.38 
 
 		 337 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  78.98 
 
 		 337 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  75.6 
 
 		 337 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  77.38 
 
 		 337 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  77.78 
 
 		 337 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3274  allantoicase  74.17 
 
 		 336 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  72.97 
 
 		 336 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  73.27 
 
 		 336 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  66.47 
 
 		 334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  64.07 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  61.24 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  59.19 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  56.83 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  55.59 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  57.94 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  57.63 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  54.06 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  41.77 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  42.37 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  42.99 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  42.04 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  42.86 
 
 		 340 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  43.79 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  42.59 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  41.19 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  41.54 
 
 		 331 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  43.96 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  41.62 
 
 		 516 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  40.24 
 
 		 520 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  40 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  39.75 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  39.75 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  39.13 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  39.7 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  32.53 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  34.51 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  33.43 
 
 		 814 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  35.65 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  41.51 
 
 		 222 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>