70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1298 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  92.88 
 
 
337 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  100 
 
 
337 aa  700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  92.58 
 
 
337 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  87.46 
 
 
337 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  86.57 
 
 
337 aa  634    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  86.57 
 
 
384 aa  634    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  86.87 
 
 
337 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  86.87 
 
 
337 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  86.57 
 
 
337 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  87.16 
 
 
337 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  86.57 
 
 
337 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  86.27 
 
 
384 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  86.27 
 
 
337 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  86.57 
 
 
337 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  86.57 
 
 
337 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  86.27 
 
 
337 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  85.97 
 
 
337 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  85.07 
 
 
337 aa  621  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3274  allantoicase  79.1 
 
 
336 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  78.51 
 
 
336 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  77.91 
 
 
336 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  77.08 
 
 
336 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  75.6 
 
 
336 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  76.88 
 
 
336 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  75.6 
 
 
336 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  75 
 
 
336 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  75 
 
 
336 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  75 
 
 
357 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  75.3 
 
 
336 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  74.7 
 
 
357 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  75 
 
 
336 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  75 
 
 
336 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  76.49 
 
 
335 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  75.6 
 
 
335 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  76.19 
 
 
335 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  75.6 
 
 
335 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  76.19 
 
 
335 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  75.89 
 
 
335 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  75.6 
 
 
335 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  64.78 
 
 
334 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  62.99 
 
 
343 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  61.24 
 
 
349 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  59.01 
 
 
331 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  56.52 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  57.63 
 
 
331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  57.76 
 
 
333 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  55.62 
 
 
332 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  55.17 
 
 
332 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  43.77 
 
 
355 aa  285  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  40.72 
 
 
516 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  39.56 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  40.49 
 
 
406 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  41.27 
 
 
331 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  40.12 
 
 
346 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  38.87 
 
 
344 aa  228  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  40.74 
 
 
340 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  39.23 
 
 
520 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  39.34 
 
 
320 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  39.76 
 
 
360 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  39.13 
 
 
381 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  36.94 
 
 
375 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  37.39 
 
 
339 aa  217  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  40.67 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  38.58 
 
 
336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  38.58 
 
 
336 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  38.58 
 
 
336 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  35.01 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  33.9 
 
 
814 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  35.21 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  37.8 
 
 
222 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>