70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4857 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  100 
 
 
406 aa  812    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  70.71 
 
 
381 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  62.42 
 
 
336 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  62.42 
 
 
336 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  62.42 
 
 
336 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  59.57 
 
 
344 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  60.25 
 
 
320 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  58.01 
 
 
331 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  61.71 
 
 
317 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  55.19 
 
 
340 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  55.1 
 
 
383 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  51.15 
 
 
346 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  52.05 
 
 
375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  49.01 
 
 
360 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  43.68 
 
 
516 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  43.03 
 
 
336 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  43.61 
 
 
335 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  43.79 
 
 
335 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  42.99 
 
 
335 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  42.99 
 
 
335 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  43.3 
 
 
335 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  43.3 
 
 
335 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  42.41 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  43.21 
 
 
337 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  42.68 
 
 
335 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  43.21 
 
 
336 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  42.9 
 
 
336 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3274  allantoicase  42.9 
 
 
336 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  43.21 
 
 
337 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  41.56 
 
 
520 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  42.9 
 
 
337 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  42.59 
 
 
337 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  42.59 
 
 
337 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  42.59 
 
 
337 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  42.59 
 
 
337 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  42.41 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  40.49 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  42.59 
 
 
384 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  42.59 
 
 
384 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  42.59 
 
 
337 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  42.59 
 
 
337 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  42.59 
 
 
337 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  42.59 
 
 
337 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  42.59 
 
 
337 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  40.18 
 
 
337 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  40.18 
 
 
337 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  42.11 
 
 
336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  42.11 
 
 
336 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  42.11 
 
 
336 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  42.11 
 
 
336 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  41.8 
 
 
357 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  42.11 
 
 
336 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  41.8 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  41.36 
 
 
337 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  42.11 
 
 
336 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  40.37 
 
 
349 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  66.47 
 
 
222 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  41.1 
 
 
333 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  38.65 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  39.26 
 
 
331 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  38.96 
 
 
331 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  38.55 
 
 
355 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  40.06 
 
 
343 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  41.05 
 
 
332 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  39.81 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  38.08 
 
 
334 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  38.39 
 
 
339 aa  202  8e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  35.03 
 
 
333 aa  189  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  32.65 
 
 
814 aa  162  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  33.82 
 
 
364 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>