70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4725 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  100 
 
 
346 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  55.19 
 
 
336 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  55.88 
 
 
331 aa  357  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  54.9 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  54.9 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  51.92 
 
 
344 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  56.44 
 
 
317 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  56.05 
 
 
381 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  50.59 
 
 
340 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  51.81 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  50.43 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  51.15 
 
 
406 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  49.12 
 
 
383 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  43.91 
 
 
516 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  40.56 
 
 
520 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  42.64 
 
 
360 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  42.77 
 
 
337 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  42.48 
 
 
337 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  42.18 
 
 
337 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  41.81 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  41.81 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  41.81 
 
 
384 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  41.81 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  41.81 
 
 
384 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  41.89 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  41.89 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  41.89 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  41.81 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  41.81 
 
 
337 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  41.89 
 
 
337 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  41.79 
 
 
335 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  42.09 
 
 
335 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  41.19 
 
 
335 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  41.49 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  41.49 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  40.94 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  41.19 
 
 
335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  41.23 
 
 
337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3274  allantoicase  40.12 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  39.35 
 
 
336 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  40.64 
 
 
336 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  40.64 
 
 
337 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  40.12 
 
 
337 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  40.6 
 
 
335 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  38.76 
 
 
336 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  40.41 
 
 
336 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  39.58 
 
 
355 aa  228  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  40.48 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  40.83 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  40.83 
 
 
336 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  40.83 
 
 
336 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  40.83 
 
 
336 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  40.83 
 
 
336 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  40.53 
 
 
357 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  40.53 
 
 
357 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  40.24 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  40.91 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  38.87 
 
 
343 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  38.05 
 
 
334 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  35.93 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  37.09 
 
 
331 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  39.58 
 
 
332 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  38.53 
 
 
332 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  34.73 
 
 
331 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  37.87 
 
 
333 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  57.06 
 
 
222 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  34.44 
 
 
339 aa  190  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  30.61 
 
 
333 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  32.2 
 
 
364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  30.34 
 
 
814 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>