More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3702 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3702  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 566 aa  1132    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 559 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  31.59 
 
 		 549 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  31.23 
 
 		 549 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.86 
 
 		 552 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 		 549 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  32.21 
 
 		 552 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  31.27 
 
 		 544 aa  257  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.22 
 
 		 552 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  31.42 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  30.67 
 
 		 549 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 		 566 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  30.48 
 
 		 549 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  30.48 
 
 		 549 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  30.38 
 
 		 549 aa  242  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  31.75 
 
 		 576 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  30.5 
 
 		 547 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  30.65 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 566 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  31.31 
 
 		 578 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  31.39 
 
 		 564 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  31.07 
 
 		 578 aa  234  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  32.43 
 
 		 575 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  28.57 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  31.76 
 
 		 575 aa  232  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  32.61 
 
 		 575 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  31.49 
 
 		 539 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  32.25 
 
 		 575 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  32.25 
 
 		 575 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 578 aa  230  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.25 
 
 		 579 aa  230  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  30.78 
 
 		 564 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  31.87 
 
 		 575 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  29.25 
 
 		 552 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  30.67 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  32.61 
 
 		 575 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  31.77 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.46 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  31.65 
 
 		 577 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  32.79 
 
 		 576 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  28.83 
 
 		 548 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  31.83 
 
 		 546 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 		 571 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  32.16 
 
 		 557 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  31.04 
 
 		 564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  29.44 
 
 		 576 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  30.83 
 
 		 571 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4363  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 		 576 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  31.02 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 563 aa  221  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 		 554 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 		 576 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  30.13 
 
 		 538 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  32.24 
 
 		 549 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 		 576 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 		 570 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 		 576 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 		 576 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 		 576 aa  220  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  31.17 
 
 		 538 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  31.37 
 
 		 576 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  32.3 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  30.31 
 
 		 571 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  28.85 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  31.37 
 
 		 576 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  32.1 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  30.14 
 
 		 574 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.79 
 
 		 828 aa  217  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  29.34 
 
 		 547 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  29.58 
 
 		 561 aa  217  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  31.72 
 
 		 562 aa  216  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1743  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 518 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1762  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 518 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.955756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1809  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 518 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.318036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 		 557 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  29.59 
 
 		 573 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 1043 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  31.51 
 
 		 572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 		 584 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  29.95 
 
 		 560 aa  214  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 540 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  29.87 
 
 		 548 aa  214  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  31.63 
 
 		 564 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 530 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 558 aa  213  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 542 aa  212  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  28.93 
 
 		 602 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 550 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 558 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 544 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  29.3 
 
 		 560 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  28.82 
 
 		 546 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  29.72 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  32.44 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  27.43 
 
 		 843 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>