47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4245 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  100 
 
 		 126 aa  253  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  70.87 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 439 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  56.67 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  56.36 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  51.67 
 
 		 436 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  45.83 
 
 		 416 aa  60.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  39.18 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  49.21 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  36.44 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  50.82 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  45.71 
 
 		 409 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  48.33 
 
 		 366 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  44.59 
 
 		 375 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  40 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  43.42 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  38.46 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  36.73 
 
 		 499 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 427 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  37.76 
 
 		 247 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  46.77 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  40.52 
 
 		 225 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  39.51 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  39.51 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  39.51 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  34.58 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  45.9 
 
 		 266 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  39.18 
 
 		 350 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  36.19 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  33.33 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  34.29 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  37.23 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  31.3 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  36.45 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  40.91 
 
 		 400 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  36.26 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  36.26 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  36.26 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  45 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  51.35 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  39.73 
 
 		 171 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  51.35 
 
 		 258 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  39.39 
 
 		 397 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  37.1 
 
 		 272 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  37.31 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  39.62 
 
 		 208 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>