More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3701 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  53.62 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  48.57 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  52.17 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  51.09 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  50.36 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  49.28 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  37.5 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  37.5 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  36.72 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  38.28 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  37.74 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  32.06 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  34.51 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  34.51 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  30.95 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  36.52 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  31.45 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  33.63 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  31.01 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  31.86 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  33.63 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  31.25 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  31.25 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  31.15 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  32.74 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  30.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  32.43 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  29.51 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  29.51 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  29.51 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  34.95 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.91 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  33.02 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  28.69 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  45.31 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  31.43 
 
 		 570 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  38.96 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  34.86 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>