165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2763 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2763  methyltransferase type 11  100 
 
 		 306 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37510  hypothetical protein  44.76 
 
 		 282 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00412109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.16 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.16 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0517  methyltransferase type 12  29.85 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  31.4 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  33.61 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  33.61 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.94 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  32.57 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  18.61 
 
 		 524 aa  50.8  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  31.79 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  26.09 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.96 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 265 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  37.04 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  36.44 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  37.74 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  31.21 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.45 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.43 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.08 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1319  methyltransferase type 12  25.24 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6510  methyltransferase type 12  25.24 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  31.45 
 
 		 235 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.93 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.88 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1409  methyltransferase type 12  32.41 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.45 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.88 
 
 		 238 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.81 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  30.18 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  32.87 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.56 
 
 		 229 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.7 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  23.94 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.23 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  27.42 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.36 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  27.64 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  32.12 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.11 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.9 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  23.88 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3663  methyltransferase type 12  25.87 
 
 		 586 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 854 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.36 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.01 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  24.47 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  23.94 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  33.82 
 
 		 504 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  23.94 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.91 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.91 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 429 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>