57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2017 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  773    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2758  hypothetical protein  55.76 
 
 		 382 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2832  hypothetical protein  53.01 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0925  hypothetical protein  48.77 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13562  hypothetical protein  49.2 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000084012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5028  hypothetical protein  49.2 
 
 		 383 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.298773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5227  hypothetical protein  49.2 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.422187  normal  0.126406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4645  hypothetical protein  49.2 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2635  hypothetical protein  54.29 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247113  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4733  hypothetical protein  49.2 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1531  hypothetical protein  49.2 
 
 		 381 aa  358  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3601  hypothetical protein  45.62 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4373  hypothetical protein  44.02 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0858648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0307  hypothetical protein  33.16 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.765461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5641  hypothetical protein  32.79 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2187  hypothetical protein  34.86 
 
 		 435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3525  hypothetical protein  33.06 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1652  hypothetical protein  31.81 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0287  hypothetical protein  32.98 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.295688  normal  0.52564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1533  sulfotransferase  32.61 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251424  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5493  sulfotransferase  33.14 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320737  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6396  hypothetical protein  31.3 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4809  sulfotransferase  33.15 
 
 		 424 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4074  hypothetical protein  31.82 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.436936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3664  hypothetical protein  28.73 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0232635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2230  hypothetical protein  31.98 
 
 		 419 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0849644  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4115  hypothetical protein  31.08 
 
 		 409 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2698  hypothetical protein  32.16 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2713  hypothetical protein  31.89 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629687  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2668  hypothetical protein  31.89 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1627  hypothetical protein  31.16 
 
 		 411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139041  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3729  hypothetical protein  30.31 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3286  hypothetical protein  30.77 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5540  hypothetical protein  33.79 
 
 		 412 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1831  hypothetical protein  31.55 
 
 		 383 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2268  hypothetical protein  32.71 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2324  hypothetical protein  29.46 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0395191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2451  hypothetical protein  30.99 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3642  hypothetical protein  27.57 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.964783  normal  0.499897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3480  hypothetical protein  29.14 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.14232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4385  hypothetical protein  30.25 
 
 		 385 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3642  hypothetical protein  30.34 
 
 		 422 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.222709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2953  hypothetical protein  30.81 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3301  hypothetical protein  31.23 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1960  hypothetical protein  29.33 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4230  hypothetical protein  27.51 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0373  hypothetical protein  28.07 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1943  hypothetical protein  27.58 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1897  hypothetical protein  27.58 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1877  hypothetical protein  27.58 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2494  hypothetical protein  26.47 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4401  hypothetical protein  26.58 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2756  hypothetical protein  25.15 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.834394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12294  hypothetical protein  25.17 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30814  predicted protein  23.57 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0754602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0831  hypothetical protein  23.16 
 
 		 437 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1729  sulfotransferase  22.82 
 
 		 336 aa  49.7  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.534947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>