More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0915 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  67.26 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  55.36 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  54.66 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  38.71 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  41.72 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1277  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 		 220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  37.74 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  41.01 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 205 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 205 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 205 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  36.72 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 205 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.91 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  39.86 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  35.46 
 
 		 213 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  39.57 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  38.12 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  37.5 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  32.37 
 
 		 198 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  38.78 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  33.51 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  29.95 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  40.29 
 
 		 181 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40.29 
 
 		 205 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40.29 
 
 		 205 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.29 
 
 		 181 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.29 
 
 		 181 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40.29 
 
 		 205 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40.29 
 
 		 205 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  35.4 
 
 		 202 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40.29 
 
 		 205 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 210 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  36.25 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  36.25 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  36.25 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  36.25 
 
 		 219 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  28.24 
 
 		 212 aa  98.6  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  36.25 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  36.25 
 
 		 219 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  35.4 
 
 		 197 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  38.35 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  39.1 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 198 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  35.57 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.57 
 
 		 219 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  40.97 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 187 aa  96.3  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  29.11 
 
 		 211 aa  95.5  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 192 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  32.56 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 211 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 201 aa  92.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.06 
 
 		 197 aa  92  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 205 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 207 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 217 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  28.28 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 217 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  29.86 
 
 		 212 aa  88.6  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  30.77 
 
 		 210 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  32.5 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 185 aa  86.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 219 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 		 203 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  27.27 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  27.8 
 
 		 222 aa  85.5  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  31.33 
 
 		 210 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  34.53 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  36.21 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  36.21 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>