153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0840 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  100 
 
 		 516 aa  1019    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  82.12 
 
 		 520 aa  841    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  51.74 
 
 		 383 aa  312  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  49.21 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  48.41 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  50.91 
 
 		 340 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  43.91 
 
 		 346 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  47.08 
 
 		 317 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  43.7 
 
 		 344 aa  266  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  44.29 
 
 		 375 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  46.69 
 
 		 320 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  43.68 
 
 		 406 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  45.27 
 
 		 336 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  45.27 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  45.27 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  41.62 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  41.62 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  41.62 
 
 		 337 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  41.62 
 
 		 337 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  41.62 
 
 		 337 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  41.62 
 
 		 337 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  41.62 
 
 		 337 aa  240  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  41.74 
 
 		 337 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  41.92 
 
 		 337 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  41.92 
 
 		 337 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  42.26 
 
 		 337 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  40.72 
 
 		 337 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  40.72 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3274  allantoicase  42.14 
 
 		 336 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  40.54 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  41.02 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  40.54 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  40.54 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  40.42 
 
 		 337 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  41.62 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  42.47 
 
 		 332 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  41.62 
 
 		 336 aa  230  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  41.32 
 
 		 335 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  41.62 
 
 		 335 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  41.79 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  40.77 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  41.14 
 
 		 336 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  41.32 
 
 		 336 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  41.02 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  37.91 
 
 		 355 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  41.02 
 
 		 335 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  40.74 
 
 		 360 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  41.02 
 
 		 335 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  41.02 
 
 		 335 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  40.65 
 
 		 335 aa  223  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  38.46 
 
 		 334 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  40.24 
 
 		 336 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  40.24 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  40.54 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  39.94 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  39.94 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  39.94 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  39.94 
 
 		 357 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  39.94 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  40.24 
 
 		 349 aa  216  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  37.54 
 
 		 331 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  38.02 
 
 		 331 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  37.27 
 
 		 331 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  40 
 
 		 333 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  37.91 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  33.03 
 
 		 339 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  34.72 
 
 		 333 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  37.22 
 
 		 364 aa  176  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  52.78 
 
 		 222 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  30.03 
 
 		 814 aa  160  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  38.55 
 
 		 188 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  33.71 
 
 		 168 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  41.82 
 
 		 197 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  41.52 
 
 		 163 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  43.33 
 
 		 231 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  43.02 
 
 		 196 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  41.38 
 
 		 193 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  32.54 
 
 		 169 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  38.01 
 
 		 177 aa  97.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  45.61 
 
 		 179 aa  96.7  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  39.61 
 
 		 165 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  37.93 
 
 		 165 aa  94  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  35.59 
 
 		 164 aa  94  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  35.43 
 
 		 165 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  37.87 
 
 		 166 aa  86.7  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  34.52 
 
 		 825 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  34.17 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  43.31 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  34.32 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  36.78 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  36.57 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  34.29 
 
 		 138 aa  74.3  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  40.23 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  26.79 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  33.73 
 
 		 170 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  24.57 
 
 		 172 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  27.68 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  26.8 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  24.57 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>