More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0847 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0847  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  867    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0734  seryl-tRNA synthetase  74 
 
 		 423 aa  658    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03775  seryl-tRNA synthetase  73.05 
 
 		 423 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.64354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5630  seryl-tRNA synthetase  67.69 
 
 		 423 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00319039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0415  seryl-tRNA synthetase  65.01 
 
 		 423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0216  seryl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 424 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3818  seryl-tRNA synthetase  64.88 
 
 		 430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225862  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 423 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  55.19 
 
 		 434 aa  477  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 422 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 431 aa  359  6e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 423 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 423 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 430 aa  350  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 428 aa  349  5e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl017  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 422 aa  349  6e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 430 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 422 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 426 aa  346  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 422 aa  345  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 428 aa  344  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 413 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 423 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  45 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 425 aa  342  8e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 427 aa  342  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 413 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 425 aa  340  4e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 426 aa  339  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0744  seryl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 461 aa  338  8e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124446  normal  0.521424 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 423 aa  338  8e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 424 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 427 aa  336  5e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 423 aa  336  5.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 442 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 427 aa  335  5.999999999999999e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 427 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 425 aa  334  1e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 444 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 426 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 430 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 421 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 427 aa  331  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2257  seryl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>