More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2445 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2445  NusG antitermination factor  100 
 
 
172 aa  347  5e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.012878  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12290  transcription antiterminator  56.55 
 
 
169 aa  201  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369392  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1880  NusG antitermination factor  49.11 
 
 
170 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  hitchhiker  0.00000812866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1920  NusG antitermination factor  41.18 
 
 
170 aa  143  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  hitchhiker  0.00427943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1881  NusG antitermination factor  40.36 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.541166  hitchhiker  0.00000716942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  35.47 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0849  NusG antitermination factor  30.86 
 
 
173 aa  92  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1362  NusG antitermination factor  33.14 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0821693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  28.14 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0523  transcription antitermination protein NusG  29.41 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0829173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0503  transcription antitermination protein NusG  29.41 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1461  transcription antitermination protein NusG  29.41 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0176  transcription antitermination protein NusG  31.58 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  30.95 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  28.66 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0348  transcription termination/antitermination factor NusG  30.12 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0068179  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1321  transcription antitermination protein NusG  30.12 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0169  transcription antitermination protein NusG  30.12 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0213318  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0444  transcription antitermination protein NusG  27.65 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00370515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  25.15 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1668  transcription antitermination protein NusG  26.74 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0130356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  26.74 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0348  transcription antitermination protein NusG  25 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000375919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  26.55 
 
 
190 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  25.42 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  25 
 
 
184 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  25.57 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  24.16 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0957  transcription antitermination protein NusG  28.32 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  25.97 
 
 
177 aa  57.8  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  24.54 
 
 
180 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  24.43 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  26.55 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  24.16 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  25 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0713  NusG family transcription antitermination protein  28.32 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0218939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  24.29 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  24.29 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  26.82 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  26.29 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  24.29 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  24.29 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  24.86 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  24.86 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  24.86 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  24.29 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  24.86 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  26.63 
 
 
195 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  27.68 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  28.98 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  23.73 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  23.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  28.65 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  28.65 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  28.65 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  27.78 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  23.76 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0164  transcription antitermination protein NusG  27.68 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  27.68 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  27.68 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  28.65 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  28.65 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  28.65 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  27.68 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  28.65 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  27.68 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  28.65 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  22.98 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 
181 aa  54.3  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  24.16 
 
 
180 aa  54.3  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  29.78 
 
 
181 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  29.78 
 
 
181 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  29.78 
 
 
181 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2182  NusG antitermination factor  23.12 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0729444  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  26.52 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  25.82 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  25.14 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  24.24 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  26.09 
 
 
280 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  24.39 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  23.67 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  24.86 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  26.52 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  28.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  26.71 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  25.99 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  28.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1892  transcription antitermination protein nusG  22.54 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.194693  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  28.25 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  26.47 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  24.16 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2041  NusG antitermination factor  23.84 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215719  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  28 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>