More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0348 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0348  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000375919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0503  transcription antitermination protein NusG  64.77 
 
 		 177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000847234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0523  transcription antitermination protein NusG  64.77 
 
 		 177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0829173  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0169  transcription antitermination protein NusG  64.57 
 
 		 176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0213318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1461  transcription antitermination protein NusG  64.77 
 
 		 177 aa  241  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0176  transcription antitermination protein NusG  63.43 
 
 		 176 aa  239  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0444  transcription antitermination protein NusG  65.14 
 
 		 176 aa  238  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00370515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0348  transcription termination/antitermination factor NusG  59.43 
 
 		 176 aa  233  8e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0068179  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1321  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 176 aa  231  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1668  transcription antitermination protein NusG  57.8 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0130356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  41.38 
 
 		 177 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  41.95 
 
 		 175 aa  160  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  41.95 
 
 		 175 aa  160  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  43.93 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  44.32 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  42.29 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  41.14 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 		 182 aa  157  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  40.57 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  41.34 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000164845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  40.78 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  40 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  42.86 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  42.29 
 
 		 176 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  41.14 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  39.77 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0593  NusG antitermination factor  40.45 
 
 		 190 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  41.38 
 
 		 175 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  44.25 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  43.68 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  41.71 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  43.68 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  43.68 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  43.68 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  41.62 
 
 		 180 aa  154  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 182 aa  154  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 193 aa  154  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  41.38 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  39.44 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  40.45 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  44 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  40.45 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  42.77 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  41.62 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  40.45 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  40.45 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4777  transcription termination/antitermination factor NusG  40.7 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  44 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  43.02 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  40.45 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  39.89 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  39.89 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  41.48 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  39.89 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  39.89 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  40.8 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  41.04 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  39.89 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>