49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2260 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 72 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  51.67 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  47.83 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 206 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  39.06 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  34.38 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1443  hypothetical protein  48.78 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  38.46 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  32.26 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5997  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.68 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 83 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.23 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  37.88 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.23 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  29.23 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.23 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  45.76 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  45.76 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  34.85 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  29.23 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  45.76 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1094  hypothetical protein  33.85 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>