More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3178 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
329 aa  679    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  69.82 
 
 
329 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  70.73 
 
 
329 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  58.36 
 
 
332 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  37.81 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 
360 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
341 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
357 aa  89.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
325 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.89 
 
 
1099 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
325 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
327 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.85 
 
 
325 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
369 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  33.67 
 
 
236 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.07 
 
 
927 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.07 
 
 
1115 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.07 
 
 
1119 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
268 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.96 
 
 
1115 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
297 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.07 
 
 
1115 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.48 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
247 aa  56.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.64 
 
 
872 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
397 aa  55.8  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.28 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  26.42 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
654 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.65 
 
 
123 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  23.77 
 
 
752 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  21.3 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  21.09 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
445 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.11 
 
 
1115 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
235 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
597 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
410 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
235 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  34.74 
 
 
234 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  22.81 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
359 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
327 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  22.58 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  27.27 
 
 
306 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  23.9 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  25.23 
 
 
316 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  25.91 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 
642 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.12 
 
 
341 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11310  predicted glycosyltransferase  27.08 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.410703  normal  0.289206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 
620 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
221 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.69 
 
 
461 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
1177 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  21.61 
 
 
442 aa  50.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
523 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
260 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.35 
 
 
260 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>