273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1315 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  57.16 
 
 		 885 aa  1085    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  96.25 
 
 		 881 aa  1747    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  55.32 
 
 		 844 aa  970    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  55.99 
 
 		 881 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  53.14 
 
 		 846 aa  928    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  56.11 
 
 		 881 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.66 
 
 		 828 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  77.66 
 
 		 882 aa  1436    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  55.87 
 
 		 881 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  57.39 
 
 		 885 aa  1090    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  96.94 
 
 		 881 aa  1785    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  55.99 
 
 		 881 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  89.08 
 
 		 860 aa  1610    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  96.89 
 
 		 579 aa  1158    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  98.52 
 
 		 880 aa  1803    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 881 aa  1832    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.34 
 
 		 826 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  57.16 
 
 		 885 aa  1084    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  51.44 
 
 		 835 aa  867    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  98.3 
 
 		 880 aa  1803    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  41.83 
 
 		 826 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  41.59 
 
 		 826 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  56.93 
 
 		 885 aa  1081    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.07 
 
 		 845 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02222  hypothetical protein  94.97 
 
 		 298 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  37.93 
 
 		 830 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.96 
 
 		 832 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.23 
 
 		 829 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.27 
 
 		 828 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.29 
 
 		 828 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.41 
 
 		 828 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.21 
 
 		 828 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.41 
 
 		 828 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.63 
 
 		 817 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  37.81 
 
 		 829 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  37.46 
 
 		 829 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  37.31 
 
 		 829 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  37.57 
 
 		 829 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  37.19 
 
 		 829 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.52 
 
 		 832 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  35.88 
 
 		 834 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  35.52 
 
 		 833 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  35.52 
 
 		 822 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.52 
 
 		 821 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  35.52 
 
 		 812 aa  512  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  34.2 
 
 		 816 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.35 
 
 		 819 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  34.35 
 
 		 833 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  34.35 
 
 		 816 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  34.35 
 
 		 833 aa  502  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  34.35 
 
 		 833 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.47 
 
 		 818 aa  492  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  34.26 
 
 		 792 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  33.79 
 
 		 813 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.79 
 
 		 813 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  33.66 
 
 		 813 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  33.66 
 
 		 813 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  30.97 
 
 		 820 aa  360  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.84 
 
 		 877 aa  293  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  29.1 
 
 		 840 aa  291  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  28.93 
 
 		 839 aa  287  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.92 
 
 		 837 aa  285  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  29.86 
 
 		 833 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  29.51 
 
 		 833 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  29.77 
 
 		 850 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  29.66 
 
 		 833 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  26.43 
 
 		 863 aa  281  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  27.47 
 
 		 866 aa  280  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  26.43 
 
 		 878 aa  280  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.43 
 
 		 878 aa  280  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  26.43 
 
 		 878 aa  280  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.98 
 
 		 840 aa  279  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  26.62 
 
 		 878 aa  278  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  27.81 
 
 		 863 aa  278  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  27.24 
 
 		 866 aa  276  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  27.82 
 
 		 866 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  26.26 
 
 		 856 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  27.35 
 
 		 838 aa  275  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  27.22 
 
 		 848 aa  275  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.13 
 
 		 866 aa  275  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  27.14 
 
 		 848 aa  275  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  27.35 
 
 		 838 aa  275  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  27.33 
 
 		 866 aa  275  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  27.35 
 
 		 838 aa  275  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  28.67 
 
 		 866 aa  275  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  27.02 
 
 		 848 aa  274  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  29.04 
 
 		 809 aa  274  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.58 
 
 		 838 aa  273  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  27.01 
 
 		 866 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  27.01 
 
 		 866 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  27.26 
 
 		 838 aa  273  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  27.8 
 
 		 873 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  27.8 
 
 		 888 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  27.02 
 
 		 848 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  29.01 
 
 		 809 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  28.92 
 
 		 809 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  28.92 
 
 		 809 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.23 
 
 		 838 aa  272  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  28.4 
 
 		 844 aa  272  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  27.8 
 
 		 888 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>