More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2222 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  50.89 
 
 		 653 aa  655    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 		 643 aa  648    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  49.31 
 
 		 664 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  49.77 
 
 		 660 aa  649    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2481  AMP-dependent synthetase and ligase  51.14 
 
 		 620 aa  636    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0503355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  78.19 
 
 		 651 aa  1014    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  50.61 
 
 		 657 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  49.38 
 
 		 658 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  53.76 
 
 		 644 aa  656    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  50.69 
 
 		 657 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  52.21 
 
 		 632 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  50.76 
 
 		 673 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  71.23 
 
 		 659 aa  937    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 		 656 aa  657    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  49.46 
 
 		 655 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  52.68 
 
 		 631 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  51.62 
 
 		 656 aa  641    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  53 
 
 		 631 aa  692    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  49.62 
 
 		 664 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  59.97 
 
 		 648 aa  811    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  48.54 
 
 		 660 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  50.46 
 
 		 656 aa  651    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  49.14 
 
 		 652 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  50.78 
 
 		 649 aa  643    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  49.38 
 
 		 650 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  49.46 
 
 		 655 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  50.93 
 
 		 655 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  50.38 
 
 		 658 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  51.15 
 
 		 658 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  50.23 
 
 		 660 aa  655    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  49.17 
 
 		 659 aa  635    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  49.92 
 
 		 670 aa  655    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  49.7 
 
 		 660 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  52.37 
 
 		 632 aa  689    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  50.15 
 
 		 657 aa  638    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  51.63 
 
 		 638 aa  644    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  48.23 
 
 		 660 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 648 aa  1308    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  49.24 
 
 		 650 aa  660    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  50.32 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  50.15 
 
 		 661 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  48.69 
 
 		 658 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  48.23 
 
 		 660 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  50.54 
 
 		 648 aa  634  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  49.76 
 
 		 639 aa  634  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  49.92 
 
 		 658 aa  632  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  47.99 
 
 		 653 aa  629  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  49.23 
 
 		 655 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  47.58 
 
 		 629 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  47.74 
 
 		 649 aa  631  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  49.38 
 
 		 651 aa  629  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  46.85 
 
 		 660 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 		 666 aa  626  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  50.79 
 
 		 629 aa  627  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  49.07 
 
 		 655 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  50.74 
 
 		 667 aa  626  1e-178  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  47.83 
 
 		 632 aa  623  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  46.11 
 
 		 664 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  49.09 
 
 		 663 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  46.52 
 
 		 652 aa  625  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  50 
 
 		 649 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  49.69 
 
 		 657 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  48.93 
 
 		 715 aa  621  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  49.85 
 
 		 667 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  50.23 
 
 		 661 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  48.22 
 
 		 656 aa  615  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  45.83 
 
 		 657 aa  617  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  45.99 
 
 		 666 aa  615  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  47.71 
 
 		 638 aa  617  1e-175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  47.78 
 
 		 629 aa  616  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  48.93 
 
 		 661 aa  616  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  48.69 
 
 		 680 aa  615  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  49.15 
 
 		 650 aa  614  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  49.07 
 
 		 661 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  48.53 
 
 		 655 aa  614  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  48.66 
 
 		 631 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 		 666 aa  612  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  47.11 
 
 		 652 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  49.54 
 
 		 667 aa  609  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  46.3 
 
 		 667 aa  611  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  49.68 
 
 		 654 aa  611  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  49.61 
 
 		 646 aa  609  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  45.61 
 
 		 667 aa  608  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  49.92 
 
 		 656 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  45.62 
 
 		 667 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  48.38 
 
 		 655 aa  611  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  48.54 
 
 		 656 aa  609  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  49.24 
 
 		 661 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 		 670 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  45.97 
 
 		 625 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  47.31 
 
 		 629 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  46.45 
 
 		 652 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  51.96 
 
 		 659 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1868  acetate/CoA ligase  48.45 
 
 		 652 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.477544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  45.83 
 
 		 652 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  47.93 
 
 		 631 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  48.29 
 
 		 635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  47.88 
 
 		 632 aa  598  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  47.23 
 
 		 657 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  49.75 
 
 		 668 aa  598  1e-170  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>