86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2200 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  68.04 
 
 
317 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  60.63 
 
 
305 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2891  hypothetical protein  60.19 
 
 
299 aa  316  5e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0197559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  57.32 
 
 
319 aa  315  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  55.87 
 
 
317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  49.38 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  48.61 
 
 
322 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  53.16 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  29.49 
 
 
312 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  26.65 
 
 
317 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  27.24 
 
 
567 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  26.1 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  26.57 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  29.93 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  26.49 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  28.43 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.99 
 
 
315 aa  60.1  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.06 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  25.75 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2255  hypothetical protein  23.99 
 
 
671 aa  56.2  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00144777  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  29.75 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.09 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  24.91 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5209  hypothetical protein  43.86 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  25.53 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  25.47 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  24.72 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  25.47 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  25.95 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  25.47 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  25.39 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  25.47 
 
 
262 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  25.47 
 
 
266 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  25.47 
 
 
266 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  26.45 
 
 
380 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  29.47 
 
 
308 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  23.91 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  25.32 
 
 
266 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  26.33 
 
 
306 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  22.94 
 
 
275 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  22.94 
 
 
275 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  23.99 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  25.41 
 
 
316 aa  50.8  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  23.68 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  24.45 
 
 
304 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  24.09 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  25.74 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  24.6 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  26.92 
 
 
251 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  24.68 
 
 
306 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  26.92 
 
 
251 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  27.63 
 
 
352 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  23.99 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  21.5 
 
 
2798 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  25.17 
 
 
139 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  23.36 
 
 
305 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  27.93 
 
 
439 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  28.21 
 
 
121 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  21.79 
 
 
266 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  23.68 
 
 
416 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  29.36 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  23.57 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  25.42 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  28.78 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  27.52 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  29.2 
 
 
271 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0852  protein of unknown function DUF81  24.83 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  29.06 
 
 
123 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  23.94 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  31.52 
 
 
249 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  29.75 
 
 
119 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  28.1 
 
 
261 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  19 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  31.68 
 
 
254 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  23.2 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  24.52 
 
 
312 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  29.25 
 
 
121 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  28.71 
 
 
249 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.68 
 
 
255 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  31.25 
 
 
291 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  31.25 
 
 
291 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  31.25 
 
 
291 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2123  hypothetical protein  30.4 
 
 
261 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>