More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1622 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  75 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  71.58 
 
 		 297 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.85 
 
 		 302 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  65.31 
 
 		 305 aa  388  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  42.66 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  40.55 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.45 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1252  Thioredoxin-disulfide reductase  41.2 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  36.79 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  36.88 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  35.29 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.78 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  35.5 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  34.22 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.67 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  34.64 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  36.45 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  35.67 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  31.35 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  35.64 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.89 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  34.75 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  32.89 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  32.39 
 
 		 352 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  32.78 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  32.37 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  33.66 
 
 		 552 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  32.79 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  34.84 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1021  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.664925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  34.28 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  35.46 
 
 		 361 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.79 
 
 		 548 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.67 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  32.69 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  33.88 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  34.32 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  33.77 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  34.29 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  33.66 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.2 
 
 		 551 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  33.66 
 
 		 324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  32.45 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  32.9 
 
 		 319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.11 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 579 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  33.75 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  32.51 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  33.11 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1749  thioredoxin-disulfide reductase  33.89 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.78 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  34.21 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  31.1 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  33.54 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  32.47 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  33.44 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  32.28 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  33.87 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  34.75 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  32.48 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  34.19 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  35.44 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  32.91 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  34.31 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  33.69 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  33 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  31.31 
 
 		 310 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  32.81 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  33.11 
 
 		 547 aa  125  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  32.91 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  31.02 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  32.6 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  32.6 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  31.27 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  31.49 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  32.79 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  32.5 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.97 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  32.24 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  34.74 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  32.33 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  34.08 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.63 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  32.24 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  32.5 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  32.67 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  32.47 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  30.26 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  32.67 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  33 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  32.57 
 
 		 550 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  32.87 
 
 		 329 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  33.23 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>