More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2332 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2332  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2829  response regulator receiver protein  83.33 
 
 		 126 aa  201  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3609  response regulator receiver domain-containing protein  77.87 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  58.97 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1110  response regulator receiver protein  56.14 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0458  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3253  response regulator  44.44 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2959  two component signal transduction response regulator  43.22 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.888929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3403  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 124 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.809384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3466  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3179  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.164981 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0027  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  36.29 
 
 		 455 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0029  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.29 
 
 		 455 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.59486  normal  0.125276 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0352  nitrogen regulation protein NR(I)  37.17 
 
 		 478 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4822  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  37.17 
 
 		 478 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0339  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  37.17 
 
 		 478 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5048  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  35.71 
 
 		 478 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5101  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  35.71 
 
 		 478 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4923  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  35.71 
 
 		 478 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0415  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  35.71 
 
 		 478 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.855382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1745  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45900  nitrogen regulation protein, sigma 54-dependent response regulator NtrC (NR(I))  36.28 
 
 		 478 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5859  two-component response regulator NtrC  34.92 
 
 		 476 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67680  two-component response regulator NtrC  34.92 
 
 		 476 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000437551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4144  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  35.77 
 
 		 477 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 454 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2554  type 4 fimbriae expression regulatory protein PilR  35.77 
 
 		 452 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.54 
 
 		 470 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0734  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  32.23 
 
 		 477 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  39.2 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3260  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.35 
 
 		 450 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 457 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1215  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  33.33 
 
 		 471 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1973  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00115006  hitchhiker  0.0000141072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 688 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0016  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  36.67 
 
 		 468 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0855054  normal  0.786337 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2271  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.420434  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  36.45 
 
 		 286 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 237 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 375 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  37.72 
 
 		 227 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.44 
 
 		 318 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5493  sporulation initiation phosphotransferase F  35 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000162821  unclonable  2.17721e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.25 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0182  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.79 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.745426 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3178  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  36.61 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0237  response regulator receiver  36.79 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5459  sporulation initiation phosphotransferase F  35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000856307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5466  stage 0 sporulation protein F  35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0750811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5185  stage 0 sporulation protein F  35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0413406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.82 
 
 		 446 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5020  stage 0 sporulation protein F  35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000180816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5036  stage 0 sporulation protein F  35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000486089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2017  response regulator CheY  38.05 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5134  response regulator receiver protein  35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5581  stage 0 sporulation protein F  35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2408  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.48 
 
 		 482 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3169  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.26 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254755  normal  0.187976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5429  sporulation initiation phosphotransferase F  35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.26925e-31 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1810  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.48 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0643  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5514  sporulation initiation phosphotransferase F  35 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000170867  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  35.29 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  38.39 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1804  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 469 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358984  normal  0.379225 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1994  two component signal transduction response regulator  35.96 
 
 		 477 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 476 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3962  nitrogen regulation protein NR(I)  35.29 
 
 		 470 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>