More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1585 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  40.37 
 
 
224 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  41.31 
 
 
219 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  40.61 
 
 
209 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  43.01 
 
 
223 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  40.41 
 
 
256 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  39.9 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  40.11 
 
 
215 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  37.56 
 
 
211 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  40.11 
 
 
215 aa  138  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 
230 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35.89 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  35.03 
 
 
223 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  35.43 
 
 
208 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  42.95 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  35.35 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  36.27 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  33.5 
 
 
219 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  41.03 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  40.62 
 
 
215 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  42.13 
 
 
216 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.8 
 
 
214 aa  121  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  35.03 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  37.3 
 
 
220 aa  118  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  41.01 
 
 
216 aa  117  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  35.03 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  36.49 
 
 
230 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  33.02 
 
 
217 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  35.33 
 
 
216 aa  111  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  34.09 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  43.94 
 
 
145 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
232 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  35.71 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  34.38 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 
144 aa  92  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 
144 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.91 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  30.07 
 
 
147 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  30.07 
 
 
147 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  30.14 
 
 
149 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  27.52 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.32 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  30.63 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  30.63 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  30.63 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  30.63 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  30.63 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  30.63 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  30.63 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  30 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  30 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  30 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  33.15 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  25.99 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  31.62 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  34.9 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  25.23 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  33.76 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32.35 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.35 
 
 
845 aa  72  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 
143 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
140 aa  72  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 
142 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.86 
 
 
146 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.86 
 
 
146 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  33.09 
 
 
147 aa  70.9  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.07 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.86 
 
 
146 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  35.33 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  36.09 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  32.03 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.48 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  34.38 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  32.37 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  35.22 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.03 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  26.7 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.81 
 
 
769 aa  68.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  36.09 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  31.85 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.81 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 
139 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 
143 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
145 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  37.12 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  33.99 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  34.9 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>