47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1042 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  497  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.61 
 
 		 711 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.317292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  37.12 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2375  hypothetical protein  34.69 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2137  hypothetical protein  38.58 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0601271  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3144  hypothetical protein  37.5 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0778094  normal  0.041607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1208  hypothetical protein  38.46 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2599  hypothetical protein  38.19 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3246  hypothetical protein  38.5 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00816  hypothetical protein  32 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  36.5 
 
 		 581 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  24.73 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  29.51 
 
 		 414 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  27.88 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 1340 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  32.56 
 
 		 425 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 457 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  30.43 
 
 		 524 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  28.92 
 
 		 406 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  26.26 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  26.6 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  35.59 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  30.36 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 1523 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 1162 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 494 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  33.73 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 1523 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23.2 
 
 		 326 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  29.49 
 
 		 468 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0420  hypothetical protein  28.03 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  25.57 
 
 		 391 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  31.58 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.4 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.87 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  30 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  30.38 
 
 		 511 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 470 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  35.4 
 
 		 504 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>