More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1543 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  100 
 
 
507 aa  1013    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  58.51 
 
 
501 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  58.51 
 
 
501 aa  581  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  56.39 
 
 
517 aa  579  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  53.79 
 
 
542 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  53.79 
 
 
542 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  54.03 
 
 
509 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  53.4 
 
 
575 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  53.79 
 
 
575 aa  565  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  53.59 
 
 
537 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.81 
 
 
512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  52.82 
 
 
542 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  54.62 
 
 
517 aa  558  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  55.58 
 
 
513 aa  561  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  53.79 
 
 
540 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  55.31 
 
 
510 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  54.53 
 
 
514 aa  561  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  53.15 
 
 
517 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  54.56 
 
 
528 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  53.98 
 
 
528 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  53.59 
 
 
528 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.03 
 
 
516 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54.1 
 
 
515 aa  555  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  54.03 
 
 
512 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  54.33 
 
 
511 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  53.94 
 
 
511 aa  555  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  54.17 
 
 
528 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  52.69 
 
 
522 aa  551  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  53.63 
 
 
510 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.54 
 
 
512 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  53.54 
 
 
516 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  52.76 
 
 
513 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  53.4 
 
 
540 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  53.54 
 
 
511 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  52.56 
 
 
516 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  52.76 
 
 
516 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  53.52 
 
 
516 aa  547  1e-154  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  52.65 
 
 
509 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  52.23 
 
 
548 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  52.85 
 
 
510 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  52.56 
 
 
512 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  52.25 
 
 
522 aa  543  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  52.95 
 
 
512 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  53.15 
 
 
511 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  52.76 
 
 
515 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  54.12 
 
 
511 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  52.95 
 
 
515 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  53.54 
 
 
511 aa  545  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  52.76 
 
 
512 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  51.65 
 
 
528 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  51.46 
 
 
528 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  52.76 
 
 
512 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  52.66 
 
 
511 aa  544  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  52.76 
 
 
512 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  52.06 
 
 
513 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  52.76 
 
 
511 aa  541  1e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.73 
 
 
511 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  52.47 
 
 
505 aa  542  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  51.84 
 
 
528 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  52.46 
 
 
509 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.98 
 
 
517 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.83 
 
 
510 aa  539  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  51.55 
 
 
521 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  52.76 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  52.76 
 
 
515 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  51.57 
 
 
507 aa  540  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  51.84 
 
 
528 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  50.79 
 
 
517 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  54.13 
 
 
510 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  53.82 
 
 
518 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  51.72 
 
 
526 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  52.17 
 
 
512 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  51.57 
 
 
513 aa  538  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  52.95 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  53.42 
 
 
518 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  51.16 
 
 
520 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  50.79 
 
 
517 aa  537  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  52.26 
 
 
513 aa  531  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  52.65 
 
 
513 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  52.84 
 
 
520 aa  532  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  52.26 
 
 
513 aa  531  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  50.68 
 
 
528 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  50.39 
 
 
525 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  50.77 
 
 
525 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  50.39 
 
 
525 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  53.42 
 
 
520 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  50.39 
 
 
525 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  50.39 
 
 
525 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  53.23 
 
 
521 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  51.08 
 
 
514 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  51.08 
 
 
514 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  51.38 
 
 
523 aa  531  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  50.39 
 
 
518 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  53.35 
 
 
510 aa  529  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  50.2 
 
 
517 aa  531  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  51.28 
 
 
510 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  51.67 
 
 
518 aa  529  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  50.67 
 
 
527 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  50.1 
 
 
525 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  50.86 
 
 
527 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>