More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1373 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  100 
 
 		 154 aa  322  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  62.25 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  62.25 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  61.74 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  54.61 
 
 		 157 aa  186  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  55.86 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  58.57 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  53.64 
 
 		 241 aa  176  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  57.34 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  56.83 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  60.45 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  55.24 
 
 		 146 aa  173  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  57.14 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  52.26 
 
 		 170 aa  172  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  52.9 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  51.97 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  50.33 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  54.23 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  54.93 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  53.1 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  52.26 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  52.38 
 
 		 245 aa  167  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  50 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  50.98 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  53.59 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  57.14 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  49.02 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  49.02 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  50.98 
 
 		 154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  54.29 
 
 		 146 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  49.03 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  50.98 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  54.55 
 
 		 161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  50 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  49.33 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  49.67 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  53.42 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  47.37 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  55.4 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  49.02 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  48.67 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  48.67 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  48.37 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  48 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  49.02 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  54.68 
 
 		 148 aa  160  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  52.11 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  47.33 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  51.95 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  47.33 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  47.33 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  47.33 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  53.9 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  52.45 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  47.33 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  49.33 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  49.33 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  50.68 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  49.33 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  53.28 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  47.4 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  53.9 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  50.33 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  53.9 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  51.75 
 
 		 145 aa  157  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  49.65 
 
 		 152 aa  156  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  49.67 
 
 		 154 aa  157  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  50.33 
 
 		 154 aa  156  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  49.01 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  46.05 
 
 		 157 aa  156  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  53.57 
 
 		 147 aa  156  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  50.35 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  49.64 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  48.99 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  47.06 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  50.7 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  52.7 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  48.97 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  52.55 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1340  Ribonuclease H  50.7 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  48.61 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  48.34 
 
 		 154 aa  153  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  48.28 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  48.28 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  48.28 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  48.28 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  48.28 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  48.28 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>