More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1114 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 605 aa  1233    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  43.09 
 
 		 607 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  43.28 
 
 		 624 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  40.6 
 
 		 601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  39.83 
 
 		 596 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  40.5 
 
 		 598 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.06 
 
 		 626 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  38.81 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  38.81 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.11 
 
 		 610 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.74 
 
 		 615 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.16 
 
 		 593 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.33 
 
 		 618 aa  290  8e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.06 
 
 		 590 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  31.66 
 
 		 590 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.3 
 
 		 586 aa  277  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.06 
 
 		 610 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.29 
 
 		 597 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.5 
 
 		 604 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.98 
 
 		 594 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.59 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  32.29 
 
 		 597 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  30.1 
 
 		 601 aa  244  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  37.19 
 
 		 243 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.45 
 
 		 438 aa  146  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.27 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  25.94 
 
 		 558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.19 
 
 		 554 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  55.36 
 
 		 112 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  26.82 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  28.97 
 
 		 557 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  29.27 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.71 
 
 		 536 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.71 
 
 		 536 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.36 
 
 		 450 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  31.41 
 
 		 538 aa  123  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.27 
 
 		 437 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35 
 
 		 442 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.42 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  32.35 
 
 		 846 aa  104  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  30.52 
 
 		 892 aa  101  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  30.39 
 
 		 890 aa  100  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  23.64 
 
 		 857 aa  99.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  32 
 
 		 846 aa  98.6  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  23.5 
 
 		 872 aa  97.8  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 890 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 892 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 892 aa  97.4  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 894 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 892 aa  97.4  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 892 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 892 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 892 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  30.13 
 
 		 890 aa  97.4  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  29.8 
 
 		 895 aa  97.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  24.86 
 
 		 903 aa  97.4  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  31.16 
 
 		 903 aa  97.1  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  32.43 
 
 		 930 aa  97.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  33 
 
 		 883 aa  96.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  24.13 
 
 		 871 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  34.9 
 
 		 896 aa  95.9  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  31.11 
 
 		 904 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  31.84 
 
 		 795 aa  96.3  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  26.54 
 
 		 910 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  31.12 
 
 		 864 aa  94.4  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  27.94 
 
 		 870 aa  94  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  27.94 
 
 		 870 aa  94  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  32.14 
 
 		 872 aa  93.6  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  25.23 
 
 		 905 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  31.28 
 
 		 900 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  31.17 
 
 		 887 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  31.36 
 
 		 867 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81012  Mismatch repair ATPase MSH6 (MutS family)  32.02 
 
 		 1212 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  30.74 
 
 		 927 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 860 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.97 
 
 		 445 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  25.29 
 
 		 889 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  25.72 
 
 		 840 aa  90.9  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  34.03 
 
 		 868 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  25.74 
 
 		 788 aa  90.9  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  30.15 
 
 		 857 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  30.17 
 
 		 872 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  30.15 
 
 		 857 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  30.15 
 
 		 880 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  31.17 
 
 		 868 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  28.77 
 
 		 865 aa  89  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  32.39 
 
 		 820 aa  89  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  29.65 
 
 		 857 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  31.28 
 
 		 1014 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 		 855 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  30.65 
 
 		 859 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 887 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  30.34 
 
 		 882 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  29.7 
 
 		 868 aa  89.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  31.19 
 
 		 776 aa  89  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  30.32 
 
 		 882 aa  89  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  29.48 
 
 		 1205 aa  89  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  31.55 
 
 		 855 aa  88.6  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  30.32 
 
 		 882 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>