51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0938 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0938  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
464 aa  947    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158667  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0405  membrane-fusion protein  29.41 
 
 
422 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.390525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3039  secretion protein HlyD  29.52 
 
 
509 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598574  normal  0.745605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1130  secretion protein HlyD  30.77 
 
 
481 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0093  membrane-fusion protein  28.57 
 
 
422 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.149408  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1754  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 
486 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0111  hypothetical protein  40 
 
 
312 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6117  type I secretion adaptor protein  25.7 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0871  hypothetical protein  35.79 
 
 
372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0894  chromosome segregation ATPase-like protein  32.83 
 
 
666 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2502  hypothetical protein  29.31 
 
 
373 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.507952  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  21.55 
 
 
498 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2229  hypothetical protein  42.19 
 
 
169 aa  63.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.513911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  22.98 
 
 
491 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.81 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  21.99 
 
 
420 aa  57.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  21.74 
 
 
420 aa  57  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  23.02 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  21.63 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 
607 aa  53.5  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.49 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.87 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.06 
 
 
465 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  23.7 
 
 
550 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.06 
 
 
465 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15721  hypothetical protein  19.8 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.33 
 
 
430 aa  50.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.24 
 
 
509 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  32.35 
 
 
457 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.96 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.07 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.79 
 
 
467 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  20.8 
 
 
417 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 
500 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  28.4 
 
 
417 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.66 
 
 
439 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  23.98 
 
 
457 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.26 
 
 
479 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.09 
 
 
460 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  22.03 
 
 
323 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  21.83 
 
 
510 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.47 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  21.93 
 
 
488 aa  44.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 
496 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.22 
 
 
445 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.89 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1000  Multidrug resistance efflux pump-like protein  21.22 
 
 
404 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  26.89 
 
 
420 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  24.86 
 
 
509 aa  43.5  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  23.2 
 
 
457 aa  43.5  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>