More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3468 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3468  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  62.09 
 
 		 226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  54.38 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3242  peptide methionine sulfoxide reductase  51.67 
 
 		 213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  46.53 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 		 183 aa  175  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  44.26 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  47.73 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  43.72 
 
 		 212 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  44.69 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  46.38 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  39.32 
 
 		 204 aa  161  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  38.76 
 
 		 368 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  42.25 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  41.53 
 
 		 191 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  41.06 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  41.53 
 
 		 191 aa  158  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  42.39 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13871  peptide methionine sulfoxide reductase  36.28 
 
 		 211 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.370801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  39.52 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  38.5 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  37.32 
 
 		 394 aa  154  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  39.72 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  41.21 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  44.56 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  35.87 
 
 		 380 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  38.46 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  35.43 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  44.51 
 
 		 321 aa  148  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  42.08 
 
 		 196 aa  148  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1431  peptide methionine sulfoxide reductase  37.14 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  40.86 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14941  peptide methionine sulfoxide reductase  39.25 
 
 		 201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.579151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  39.05 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  41.99 
 
 		 178 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  40.32 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  37.56 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  34.95 
 
 		 381 aa  145  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  40.88 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15191  peptide methionine sulfoxide reductase  36.19 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0163481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  41.99 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  41.99 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  41.44 
 
 		 320 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  39.44 
 
 		 195 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  40.88 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  37.07 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  40.88 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.44 
 
 		 321 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.44 
 
 		 321 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  40.88 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  36.24 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.44 
 
 		 321 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  41.44 
 
 		 321 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  40.33 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  41.53 
 
 		 323 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  41.44 
 
 		 178 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  37.02 
 
 		 174 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  40.33 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15331  peptide methionine sulfoxide reductase  38.62 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.33 
 
 		 321 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1184  peptide methionine sulfoxide reductase  39.13 
 
 		 203 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.88 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  39.44 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  39.78 
 
 		 321 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  35.75 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  40.33 
 
 		 321 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  41.44 
 
 		 178 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  37.36 
 
 		 177 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  37.36 
 
 		 177 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  43.03 
 
 		 180 aa  139  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  41.44 
 
 		 178 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  41.44 
 
 		 178 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  40.45 
 
 		 416 aa  138  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  40.85 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.89 
 
 		 416 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  37.91 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  35.14 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  44.06 
 
 		 171 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  38.46 
 
 		 174 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  38.42 
 
 		 397 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  34.91 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0267  peptide methionine sulfoxide reductase  38.69 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  36.46 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  42.66 
 
 		 169 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  42.66 
 
 		 169 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  42.47 
 
 		 171 aa  128  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  41.89 
 
 		 169 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  45.21 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  41.56 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  46.05 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  40.27 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  41.36 
 
 		 228 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.18 
 
 		 290 aa  121  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.18 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.73 
 
 		 333 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  41.84 
 
 		 178 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  37.85 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.22 
 
 		 351 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  38.18 
 
 		 175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>