81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3045 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 338 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.42 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.42 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.26 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  29.81 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  30.1 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  33.59 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 		 308 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  32.27 
 
 		 642 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.79 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.79 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  23.85 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  35.77 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  24.45 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  21.58 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  28.94 
 
 		 1041 aa  53.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 438 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  28.19 
 
 		 1065 aa  53.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  23.03 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  22.96 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 		 454 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.53 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 444 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  25.83 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 671 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  31.25 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  32.17 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 528 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  21 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  28.97 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 598 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2591  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.642506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.15 
 
 		 754 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>