More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1901 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
272 aa  545  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2464  dimethyladenosine transferase  50.97 
 
 
280 aa  238  8e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000579309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0501  dimethyladenosine transferase  47.92 
 
 
270 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000511271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2059  dimethyladenosine transferase  47.71 
 
 
280 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.740461  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1363  dimethyladenosine transferase  46.56 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1091  dimethyladenosine transferase  44.71 
 
 
279 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  38.34 
 
 
262 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  41.34 
 
 
269 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  40.77 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 
268 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  38.7 
 
 
268 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  35.66 
 
 
298 aa  168  7e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  39.84 
 
 
266 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  40.55 
 
 
268 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  39.22 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 
276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  39.22 
 
 
267 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 
296 aa  165  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  36.61 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  40.16 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  38.13 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 
301 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  38.98 
 
 
272 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  39.22 
 
 
267 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  39.22 
 
 
268 aa  158  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
266 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  37.08 
 
 
272 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
268 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 
258 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
268 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  36.08 
 
 
263 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  38.61 
 
 
271 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 
269 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
269 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
268 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
268 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  35.14 
 
 
277 aa  156  4e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  33.98 
 
 
258 aa  156  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  37.15 
 
 
255 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  40 
 
 
266 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  38.82 
 
 
264 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
268 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  38.82 
 
 
271 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 
270 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  38.04 
 
 
269 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  37.88 
 
 
281 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 
285 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  38.28 
 
 
274 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0368  dimethyladenosine transferase  38.28 
 
 
277 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 
278 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  38.04 
 
 
272 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 
268 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 
272 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
257 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  35.74 
 
 
271 aa  148  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
267 aa  148  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  35.52 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.22 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  35.43 
 
 
256 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  37.65 
 
 
272 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  37.11 
 
 
264 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
272 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  37.5 
 
 
272 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  38.58 
 
 
276 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
256 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
302 aa  145  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  35.83 
 
 
268 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  37.11 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  37.79 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  36.54 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  35.29 
 
 
301 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
272 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
297 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 
263 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  36.54 
 
 
267 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  36.54 
 
 
267 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  38.31 
 
 
298 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  35.57 
 
 
285 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  35.57 
 
 
285 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5760  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
266 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.220306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 
269 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
268 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  36.61 
 
 
267 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 
273 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03760  dimethyladenosine transferase  33.59 
 
 
269 aa  141  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  37.74 
 
 
288 aa  141  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>