More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1588 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.02 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  57.08 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.72 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  50.7 
 
 		 231 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  48.62 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.08 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.15 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  44.5 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.06 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.06 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  43.22 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  43.22 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.74 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 311 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  38.53 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.26 
 
 		 229 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  38.53 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  40.37 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  40.37 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  40.37 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  38.57 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  42.59 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  40.59 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.82 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  39.91 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.99 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.09 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  37.83 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  36.05 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  37.83 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.05 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  37.83 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  37.83 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  38.53 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.07 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  41.21 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  38.46 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  36.48 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  36.48 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  38.6 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.01 
 
 		 229 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  37.21 
 
 		 228 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.84 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  38.6 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.6 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  38.6 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  35.11 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.75 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.44 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.67 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  37.66 
 
 		 318 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  41.33 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  38.86 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.21 
 
 		 211 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  35.93 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  40.53 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  35.98 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  37.73 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  37.73 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  35.16 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0591  tonB-system energizer ExbB  42 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  38.68 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.05 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0268  tonB-system energizer ExbB  41.5 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.522492  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  37.04 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  36.7 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  36.7 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0672  tonB-system energizer ExbB  42 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  39.06 
 
 		 235 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  37.79 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  41.58 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5215  TonB-system energizer ExbB type-1  41.58 
 
 		 324 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  39.64 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4211  TonB-system energizer ExbB type-1  39.55 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  37.22 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  35.75 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.63 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  35.75 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  35.75 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  35.75 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.75 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  35.75 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.75 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.37 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  41.05 
 
 		 323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.77 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4649  tonB-system energizer ExbB  43.39 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  36.45 
 
 		 263 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>