31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1329 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1329  Rhomboid family protein  100 
 
 		 317 aa  624  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.29151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2506  rhomboid-like protein  42.45 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0967  rhomboid family protein  37.68 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0078595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2247  Rhomboid family protein  35.62 
 
 		 352 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0229384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3495  rhomboid family protein  39.76 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2421  rhomboid family protein  38.78 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00797483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1979  Rhomboid family protein  35.62 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2353  Rhomboid family protein  37.79 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2453  uncharacterized membrane protein  39.64 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1844  rhomboid family protein  36.77 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1665  rhomboid family protein  39.06 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3108  Rhomboid family protein  32.19 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2879  Rhomboid family protein  49.13 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.474415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1385  Rhomboid family protein  34.98 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.159221  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0982  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942219 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.54 
 
 		 486 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  29.17 
 
 		 342 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  28.57 
 
 		 554 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  29.17 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  26.53 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  27.61 
 
 		 205 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5280  hypothetical protein  32.37 
 
 		 372 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.274903  normal  0.237691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  30.63 
 
 		 186 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  28.78 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  34.87 
 
 		 569 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  28.7 
 
 		 182 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  27.51 
 
 		 579 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  27.5 
 
 		 519 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  27.61 
 
 		 205 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  29.71 
 
 		 487 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  29.71 
 
 		 487 aa  42.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>