76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1143 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.75 
 
 		 299 aa  298  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  53.12 
 
 		 301 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  48.25 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.51 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  46.9 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  49.29 
 
 		 306 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  46.21 
 
 		 302 aa  242  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  44.86 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  44.9 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  47.06 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  47.06 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  47.4 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  48.8 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  46.71 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  47.75 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.71 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  44.98 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  46.71 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  48.03 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  47.4 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  47.4 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  47.4 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  49.82 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.95 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  24.64 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  30.45 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.27 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  30.93 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.35 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.5 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  27 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.14 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  30.43 
 
 		 327 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  25.96 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  24.92 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  26.63 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  29.05 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  29.12 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  29.34 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  27.46 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  27.43 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  26.55 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.16 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 		 306 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  22.96 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  25.67 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  26.77 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  28.87 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  28.45 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.02 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  25.62 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  25.62 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.69 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  23.21 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  25.62 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  29.77 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.45 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  25.31 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.9 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.54 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  28.04 
 
 		 318 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  27.62 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>