149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0614 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0614  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  100 
 
 
332 aa  693    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.984154  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0455  N-acetylneuraminate synthase  58.88 
 
 
286 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0423  N-acetylneuraminate synthase  55.32 
 
 
288 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1140  polysaccharide biosynthesis protein, putative sialic acid synthase  53.23 
 
 
287 aa  348  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2958  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  53.29 
 
 
286 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3261  polysaccharide biosynthesis related-protein  51.85 
 
 
290 aa  345  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1405  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  52.98 
 
 
290 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.86 
 
 
342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.73 
 
 
351 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.48 
 
 
358 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0960  neuB family protein  30.08 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  28.57 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  28.3 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.3 
 
 
332 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.82 
 
 
359 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  28.75 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.16 
 
 
338 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.27 
 
 
350 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  27.56 
 
 
349 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  29.78 
 
 
330 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  29 
 
 
357 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.34 
 
 
334 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.34 
 
 
334 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.11 
 
 
334 aa  106  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  28.12 
 
 
348 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.57 
 
 
335 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  28.93 
 
 
347 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  27.3 
 
 
334 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2396  NeuB, antifreeze-like protein  30.36 
 
 
371 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  28.44 
 
 
333 aa  102  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  29.66 
 
 
359 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  28.7 
 
 
357 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  28.7 
 
 
357 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  28.39 
 
 
334 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  28.39 
 
 
334 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.02 
 
 
349 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  28.98 
 
 
333 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.68 
 
 
354 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  28.09 
 
 
337 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  29.5 
 
 
363 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.31 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  28.01 
 
 
341 aa  99.4  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1974  N-acetylneuraminate synthase  30.23 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  31.58 
 
 
360 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  28.39 
 
 
351 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.74 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  27.81 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4853  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.34 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.11 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  27.48 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.84 
 
 
350 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  28.85 
 
 
349 aa  96.3  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.07 
 
 
358 aa  96.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  26.67 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  27.67 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  29.15 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  27.22 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  23.87 
 
 
356 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.37 
 
 
338 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  28.04 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.69 
 
 
749 aa  92.8  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  29.97 
 
 
748 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.84 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  27.13 
 
 
350 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.57 
 
 
344 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  26.89 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  31.43 
 
 
672 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  27.76 
 
 
359 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.41 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  29.58 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.78 
 
 
358 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  29.47 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  29.02 
 
 
340 aa  89.4  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  28.44 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  27.39 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.37 
 
 
749 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  26.06 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.37 
 
 
749 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.69 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  26.32 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.91 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  25.63 
 
 
349 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0440  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.88 
 
 
342 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0084  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  25.33 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.174225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  26.89 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2407  N-acetylneuraminate synthase  26.6 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378262  normal  0.284066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  26.27 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.36 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  26.85 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.81 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  27.78 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  34.98 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  28.9 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2841  N-acetylneuraminate synthase  30.66 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893161  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  28.43 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  26.27 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.31 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  29.52 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.04 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  25.74 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>