More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0304 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  51.88 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  47.57 
 
 		 181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  52.53 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  48.5 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  47.06 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  43.26 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  43.26 
 
 		 185 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  43.97 
 
 		 184 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  43.26 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  41.43 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  42.55 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  40.15 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  43.18 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  42.54 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  37.35 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  36.59 
 
 		 208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  43.94 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  36.59 
 
 		 208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  41.01 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  36.9 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  33.7 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  41.98 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  38.14 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  41.3 
 
 		 206 aa  110  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  35.26 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.14 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  38.12 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.15 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  34.39 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  33.33 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  37.97 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  33.55 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  33.7 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  37.69 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.29 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  38.73 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  37.58 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.54 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.01 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  37.04 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  34.07 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  34.52 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  36.81 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  35.07 
 
 		 174 aa  101  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  36.71 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  38.73 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  36.71 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  36.71 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  38.3 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  30.37 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  34.41 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  32.81 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 175 aa  98.6  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  39.69 
 
 		 206 aa  98.2  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  37.24 
 
 		 186 aa  98.2  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  35.46 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.1 
 
 		 282 aa  97.4  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  33.55 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  37.88 
 
 		 260 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  35.66 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  37.93 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.17 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  35.21 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  35.21 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>