105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3142 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 746 aa  1464    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  30.56 
 
 		 754 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  30.38 
 
 		 704 aa  251  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  31.04 
 
 		 1118 aa  248  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  30.48 
 
 		 751 aa  243  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  29.64 
 
 		 741 aa  209  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  27.46 
 
 		 763 aa  207  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  23.74 
 
 		 758 aa  183  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0546  copper amine oxidase domain protein  27.09 
 
 		 749 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  27.38 
 
 		 784 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0939  copper amine oxidase domain-containing protein  50 
 
 		 329 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2788  copper amine oxidase domain-containing protein  54.55 
 
 		 270 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  44.64 
 
 		 549 aa  103  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  46.43 
 
 		 429 aa  101  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  42.73 
 
 		 414 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  44.54 
 
 		 625 aa  97.8  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  44.27 
 
 		 589 aa  97.4  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  44.2 
 
 		 289 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  44 
 
 		 383 aa  91.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  41.67 
 
 		 176 aa  89.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  40.32 
 
 		 421 aa  87.4  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  40.34 
 
 		 652 aa  86.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  42.86 
 
 		 366 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  34.59 
 
 		 153 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  40.87 
 
 		 320 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  44.68 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  38.66 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  39.64 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  32.26 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  40.34 
 
 		 845 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  41.07 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  40.59 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  45.05 
 
 		 282 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  38.53 
 
 		 732 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  40.45 
 
 		 263 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  36.17 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  40.22 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  41.05 
 
 		 113 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  42.16 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  35.79 
 
 		 481 aa  67  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  43.16 
 
 		 216 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  43.27 
 
 		 298 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  31.58 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  38.78 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  39.8 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  37.63 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  40.43 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  38.26 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  37.1 
 
 		 450 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  43.24 
 
 		 259 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  38 
 
 		 480 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  31.82 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  32 
 
 		 521 aa  62  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  33.93 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  39.78 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  31.73 
 
 		 1305 aa  60.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  34.02 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0501  copper amine oxidase domain protein  32.59 
 
 		 487 aa  60.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 206 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  35.58 
 
 		 292 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  31.03 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  35.64 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  35.45 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.95 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  34.07 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  33.9 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1818  copper amine oxidase domain protein  29.37 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  34.29 
 
 		 547 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 		 262 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  33 
 
 		 426 aa  56.6  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  31.14 
 
 		 319 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  29.67 
 
 		 451 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  34.91 
 
 		 529 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  35.51 
 
 		 1176 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  35 
 
 		 304 aa  55.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  34.44 
 
 		 591 aa  54.7  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  37.23 
 
 		 269 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  38.04 
 
 		 266 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  33.66 
 
 		 269 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  38.04 
 
 		 267 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  34.74 
 
 		 950 aa  53.9  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  31.93 
 
 		 269 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  32.74 
 
 		 269 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  38.04 
 
 		 262 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  30.84 
 
 		 763 aa  53.9  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  31.15 
 
 		 291 aa  53.9  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.1 
 
 		 657 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.11 
 
 		 657 aa  53.5  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  33.68 
 
 		 331 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.87 
 
 		 907 aa  52.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  29.31 
 
 		 535 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  29.77 
 
 		 340 aa  50.8  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  34.78 
 
 		 948 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 		 650 aa  50.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  31.82 
 
 		 763 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  34.04 
 
 		 323 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  34.71 
 
 		 456 aa  48.9  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  30.85 
 
 		 298 aa  48.5  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1718  copper amine oxidase domain protein  33.88 
 
 		 634 aa  47.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000557029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  34.07 
 
 		 251 aa  47.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>