27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1818 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1818  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 
527 aa  1009    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  25.48 
 
 
746 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  35.42 
 
 
751 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  32.56 
 
 
182 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  32.28 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01156  myosin class II heavy chain (MHC), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11450)  21.81 
 
 
2236 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.218273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  26.83 
 
 
269 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  26.83 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  27.63 
 
 
269 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  28.49 
 
 
1193 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  27.56 
 
 
1118 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00706  hypothetical protein similar to UsoAp (Eurofung)  24.03 
 
 
1041 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.967872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0786  cell wall anchor domain-containing protein  28.03 
 
 
317 aa  47.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0285  hypothetical protein  25.98 
 
 
401 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.543411  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  22.34 
 
 
783 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  27.8 
 
 
353 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 
746 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  55.17 
 
 
1305 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  27.27 
 
 
262 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.36 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  28.87 
 
 
1164 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92737  predicted protein  25.95 
 
 
954 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0213576  normal  0.529709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1122  BRCT domain protein  23.87 
 
 
569 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0383  hypothetical protein  25.17 
 
 
476 aa  44.3  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0266002  hitchhiker  0.0000000000664805 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 
666 aa  43.9  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  20.42 
 
 
427 aa  43.5  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.22 
 
 
667 aa  43.5  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>