115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3007 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  43.9 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  40 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  34.15 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  34.17 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  32.81 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  32.81 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  35.48 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  34.38 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  36.13 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  31.25 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  32.56 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  34.15 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  41.49 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  36.36 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  32.03 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  35.78 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  32.52 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  32.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  34.55 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  32.2 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  32.2 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  38.46 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  30.65 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  31.71 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  34.26 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  34.95 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  42.11 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  28.69 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  34.83 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  32.26 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  30.65 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  35.42 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  32.28 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  39.39 
 
 		 332 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  29.27 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  37.76 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  28.93 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  32.65 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  27.87 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  29.23 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1673  death-on-curing family protein  29.92 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.869011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  27.91 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  27.34 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  28.8 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  25.62 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  30.89 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  31.45 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  28.57 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  31.09 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  36.67 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  27.42 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  32.65 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  28 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  36.79 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  34 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  29.84 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  41.67 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  41.67 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  27.64 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  33.67 
 
 		 337 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  32.95 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  41.25 
 
 		 327 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  29.91 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  33.04 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  28.69 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.89 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  39.74 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  39.73 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  39.73 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  36.11 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  33.77 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  38.3 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  28.41 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  31.01 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  33.72 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  29.36 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  37.8 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  35.71 
 
 		 336 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  34.34 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.82 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  40.68 
 
 		 330 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  35.42 
 
 		 334 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  26.4 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  30.19 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  28.8 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  30.08 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  26.4 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  30.56 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2756  death-on-curing family protein  37.04 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0588043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.53 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  30.28 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  27.97 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  27.1 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.49 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  36.49 
 
 		 329 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  34.52 
 
 		 330 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  29.55 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  34.25 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>