More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1480 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  100 
 
 
127 aa  242  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  51.82 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  48.6 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  50.91 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 
118 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  50.91 
 
 
118 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  50.91 
 
 
118 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  50.91 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  50.91 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
118 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 
118 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  47.01 
 
 
116 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  52.25 
 
 
119 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  44.07 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  43.55 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  38.46 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  40.94 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
128 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  41.82 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  37.61 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  37.93 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  36.89 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  39.2 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.84 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  36.52 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  40.17 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  37.7 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  35.19 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  36.89 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  43.59 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  41.07 
 
 
123 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  35.25 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  38.14 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  35.45 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  34.96 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  35.04 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  37.29 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  40.19 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.67 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  38.33 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  37.5 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  43.48 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.53 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.64 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  39.22 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  41.44 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  35.77 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  33.91 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3268  CrcB protein  46.43 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  37.82 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  38.04 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  35.9 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  41.59 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  42.11 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  37.37 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>