More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0664 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0664  patatin  100 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  36.73 
 
 		 349 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  37.41 
 
 		 358 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  36.73 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  36.73 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  36.73 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  36.73 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  36.73 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  36.73 
 
 		 474 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  36.39 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  36.39 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  36.05 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  37.37 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  36.05 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  36.05 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  35.03 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  33.45 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.79 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  37.17 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  38.89 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.58 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  33.9 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  33.45 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  35.02 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  35.64 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.13 
 
 		 751 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  34.14 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  33.45 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  35.79 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  35.17 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  34.71 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  32.07 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  32.07 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  35.42 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.76 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.56 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  32.59 
 
 		 750 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  33.79 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.42 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  33.79 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.42 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  35.48 
 
 		 347 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.42 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  35.48 
 
 		 347 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.08 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  29.49 
 
 		 728 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.32 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  34.49 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.42 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  29.74 
 
 		 728 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.32 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1690  Patatin  29.25 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  29.41 
 
 		 727 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  32.85 
 
 		 286 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.99 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  33.68 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.98 
 
 		 263 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1587  patatin  32.98 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759164  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  29.05 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  34.84 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  34.26 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  34.26 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  32.3 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 734 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.37 
 
 		 728 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.56 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  32.01 
 
 		 737 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  29.45 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  35.62 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  31.44 
 
 		 777 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.86 
 
 		 275 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  31.35 
 
 		 737 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  31.35 
 
 		 738 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  31.35 
 
 		 738 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  31.35 
 
 		 738 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  30.23 
 
 		 738 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.48 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  31.65 
 
 		 259 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  34.02 
 
 		 265 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  32.47 
 
 		 728 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.52 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.49 
 
 		 733 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  32.19 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.51 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  32.13 
 
 		 790 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  30.36 
 
 		 738 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  30.36 
 
 		 738 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  30.69 
 
 		 739 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  31.51 
 
 		 754 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.49 
 
 		 728 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  29.9 
 
 		 720 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  32.65 
 
 		 738 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.86 
 
 		 760 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  29.97 
 
 		 736 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  31.08 
 
 		 735 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.16 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  30.2 
 
 		 751 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  31.21 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>