More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2625 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  69.57 
 
 		 139 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  67.15 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  62.04 
 
 		 139 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3611  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 138 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  60.87 
 
 		 138 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  63.31 
 
 		 143 aa  186  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  61.31 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  63.85 
 
 		 146 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  62.32 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  61.03 
 
 		 139 aa  184  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  61.03 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  62.32 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  61.15 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  62.32 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  61.15 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 137 aa  177  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  59.71 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  60.43 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  63.97 
 
 		 140 aa  176  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  62.5 
 
 		 140 aa  175  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  61.15 
 
 		 141 aa  175  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  61.76 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  58.99 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  59.71 
 
 		 141 aa  174  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  57.35 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 		 139 aa  173  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 141 aa  173  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 141 aa  173  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 137 aa  173  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  56.74 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  60.58 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  58.09 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 		 143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0957  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  55.47 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  59.42 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  60.14 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  58.39 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 		 140 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 143 aa  170  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  58.82 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1350  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 		 140 aa  170  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 159 aa  170  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 141 aa  170  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 143 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 		 140 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  58.82 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  60.14 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  59.12 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  56.83 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  57.25 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  54.01 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  56.83 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  56.83 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  54.68 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  56.2 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 		 140 aa  168  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  54.68 
 
 		 141 aa  167  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1311  nucleoside-diphosphate kinase  58.39 
 
 		 140 aa  168  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.587203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>