42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2274 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 376 aa  781    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  69.25 
 
 		 376 aa  571  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  66.49 
 
 		 376 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  64.17 
 
 		 376 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  63.03 
 
 		 376 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  60.8 
 
 		 375 aa  494  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  60.59 
 
 		 375 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  41.83 
 
 		 368 aa  275  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  39.89 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  38.55 
 
 		 368 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  24.71 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  29.05 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  24 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.04 
 
 		 646 aa  63.5  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  24.28 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.75 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  24.28 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.11 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.01 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.03 
 
 		 659 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  22.22 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  26.18 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.24 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  25.37 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  21.45 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  22.22 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  26.17 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  22.19 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  25.45 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  20.77 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  23.26 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.04 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  22.47 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  22.47 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  20.38 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  23.74 
 
 		 364 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  24 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  22.31 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  22.02 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  21.9 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  27.27 
 
 		 1478 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  27.57 
 
 		 1510 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>